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El área que comprende el bajo de fondo arenoso situado entre las islas El Pardito y San José, en Baja California Sur, es un polígono de aguas someras de atracción turística y pesquera. A pesar de su importancia en los procesos ecológicos para muchas especies de invertebrados, entre ellos los moluscos, esta área ha sido escasamente estudiada. La insuficiente información limita contar con una línea base de este grupo taxonómico para su adecuado manejo en términos de conservación y pesca sostenible. Este estudio se centró en caracterizar la estructura de la comunidad de moluscos en el bajo, así como en determinar su relación con el tamaño del grano del sedimento. En el verano del año 2016 se ubicaron en la zona infralitoral entre ambas islas 16 estaciones de muestreo, donde se recolectaron mediante buceo libre 32 muestras (16 biológicas y 16 de sedimentos). Se analizaron la abundancia y riqueza de especies, así como los índices de Shannon (??´) y de equidad de Pielou (??´). También se determinaron los índices de diversidad taxonómica (Distinción Taxonómica Promedio y Variación de la Distinción Taxonómica). Para relacionar el tamaño del grano del sedimento con la diversidad de moluscos se realizó el Análisis de Redundancia (RDA). En el bajo entre las islas El Pardito y San José predominan las arenas finas. Se registraron 932 organismos distribuidos en 2 clases, 11 órdenes, 22 familias, 43 géneros y 52 especies. El bivalvo Megapitaria squalida fue la especie dominante de la comunidad malacológica, mientras que Tivela byronensis fue la más abundante. No se detectaron diferencias estadísticamente significativas en los índices analizados. El tamaño del grano del sedimento estuvo relacionado con la presencia/ausencia de moluscos, pero no constituye el factor determinante en la abundancia y la riqueza de la malacofauna en el bajo.
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