Los dinoflagelados epibentónicos son microorganismos eucariotas, biflagelados, asociados al fondo marino. La importancia de este grupo en los ecosistemas someros se debe a que participan en la transferencia de materia y energía entre el fondo marino y la columna de agua. El objetivo del presente estudio fue la identificación morfológica y molecular de dinoflagelados epibentónicos del Golfo de California. Se realizaron muestreos en Bahía Concepción (playa El Requesón), Bahía de La Paz (Isla La Gaviota, El Sauzoso, Las Parcelas y El Tecolote) y en tres estaciones de la Ensenada de La Paz. Las células fueron aisladas de muestras de macroalgas de profundidades < 10 m. También se realizaron arrastres horizontales de la columna de agua en zonas someras (< 2 m). Actualmente, en el IPN-CICIMAR se mantienen 34 cepas de dinoflagelados epibentónicos que fueron aislados entre 2015 y 2022 y cultivados en condiciones variables. Las cepas fueron identificadas por medio de microscopía fotónica y electrónica de barrido y la secuenciación de las regiones 5.8S, 28S e ITS del ADN ribosomal. La combinación de estas herramientas permitió identificar 13especies, pertenecientes a los géneros Amphidinium, Coolia, Ostreopsis, Gambierdiscus, Prorocentrum, Symbiodinium y Vulcanodinium. Amphidinium operculatum y Vulcanodinium rugosum fueron identificadas por su morfología y procesos reproductivos. Se observó que las diferencias morfológicas interespecíficas (por ej., entre Prorocentrum cassubicum y P. norrisianum) son sutiles, complicando la identificación incluso al complementar herramientas morfológicas y moleculares. Los resultados de este estudio incluyen las primeras secuencias de Ostreopsis lenticularis, Gambierdiscus carpenteri, Prorocentrum concavum y Prorocentrum norrisianum para México.

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