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Los muestreos biológicos no invasivos han demostrado ser eficaces en estudios genéticos y ecológicos de mamíferos marinos. En este estudio se busca obtener perfiles genéticos de individuos de ballena azul del Golfo de California mediante métodos no invasivos (heces, piel descamada, soplos) que servirán como alternativa a los métodos semi-invasivos como lo son las biopsias, dando como prioridad que el comportamiento de los individuos no se vea alterado. Para ello, se analizó la eficiencia y reproducibilidad de muestras de heces, piel descamada y soplos, utilizando 8 microsatélites específicos de la especie, el sistema ZFX/ZFY para identificación del sexo y la región control para haplotipos. Se analizaron dentro de cada grupo de muestras diferentes preservantes para obtener mayor cantidad y calidad del ADN. La mayoría de los individuos fueron genotipificados anteriormente a partir de biopsias de piel, que sirvieron para corroborar la eficiencia de las muestras como fuente de ADN. La identificación del haplotipo mitocondrial resultó mejor con las muestras de piel descamada en DMSO y en etanol al 96% con un 88% de eficiencia global, mientras que para la identificación del sexo, las heces congeladas obtuvieron el mejor porcentaje con un 65% y para los microsatélites las heces en etanol al 96% recientes (2016) un 31% de eficiencia global. Con base en estos resultados se infiere que el bajo éxito en la asignación del genotipo se debe a la baja cantidad del ADN de las muestras ya que a pesar de la baja calidad se logró amplificar en más de la mitad de las muestras pero realizando una amplificación del mismo producto de PCR original. Se concluye que las muestras preservadas en etanol recién recolectadas mostraron una mejor eficiencia en la identificación del individuo.
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