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Los cambios en la taxocenosis de macroalgas y delcontenido de metales en sus talos indican variaciones en las concentraciones deelementos químicos en el agua, cambios que son indetectables por métodostradicionales, debido a la dinámica de la circulación en los sistemas costeros.Con el objeto de proponer un método de evaluación de la calidad de agua parasistemas costeros, comenzando con una taxocenosis de macroalgas de BajaCalifornia Sur, México registrada en 1994 y 1995, se determinó el intervalo detolerancia de 71 especies a la variación de parámetros fisicoquímicos del aguade mar (2005 - 2012) con datos depresencia para todo el planeta. La similitud entre el hábitat de las especiesmostró que estas pueden constituir taxocenosis representativas de estados decalidad en el agua de sistemas costeros. Las variables que más contribuyen alcambio en asociación de especies son el aumento en materia orgánica y silicato,con la consecuente disminución de oxígeno disuelto y de pH. Se seleccionaron Padinadurvillei y Spyridia filamentosa tolerantes amateria orgánica disueltay Ulva rigida,con el fin de investigar su capacidad como bioindicadores demetales; para esto, se recolectaron muestras compuestas en las bahías de La Paz(2013 - 2016), Guaymas y San Carlos (2016); se cuantificaron los contenidos dehierro, manganeso, níquel, cobre, zinc, cadmio y plomo. Además, se midieron lasconcentraciones de amonio, nitrito, nitrato y fosfato en el agua de mar. S. filamentosa resultó buena indicadorade cambio en la concentración de metales en el agua. Zonas con influencia deagua residual industrial presentaron altos contenidos de cadmio, zinc ymanganeso. Áreas con influencia de minería presentaron altos contenidos dehierro y cobre, mientras niveles altos de plomo y zinc se encontraron en zonasbajo la influencia del aporte de aguas residuales domésticas.
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