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Análisis metagenómico de la microbiota en juveniles de caballitos de mar (Hippocampus sp.) mantenidos en condiciones de cultivo.

Clave: 20201125
Director: Dr. Renato Peña Martínez

Resumen:

Los caballitos de mar son un grupo de peces teleósteos reunidos dentro del género Hippocampus. Son un recurso pesquero muy importante alrededor del mundo, aunque la explotación de las poblaciones silvestres, ha llevado a una reducción drástica en las poblaciones actuales. El cultivo de caballitos de mar representa una solución para solventar el problema de un comercio insostenible. Sin embargo, cultivar estos organismos resulta difícil, en parte, por su vulnerabilidad a los afloramientos infecciosos de origen bacteriano que reducen seriamente la producción. El conocimiento de la comunidad bacteriana presente en cultivos comerciales de caballitos de mar durante las condiciones estándar de cultivo, es prácticamente inexistente. Dado que la caracterización convencional de los microorganismos ha dependido de técnicas basadas en muestras cultivables y posterior aislamiento, la comprensión de la composición de la microbiota se ha restringido. Sin embargo, recientemente, el desarrollo de técnicas que permiten el análisis genómico de un conjunto de microorganismos, incluidas aquellas especies que no pueden cultivarse mediante técnicas convencionales de microbiología, ofrece nuevas oportunidades para estudiar las comunidades microbianas en sus entornos naturales y/o artificiales. De esta forma, en la presente propuesta se pretende generar un panorama general que permita establecer los diferentes tipos de microbiota presentes tanto en el sistema de cultivo, como en los individuos, durante el cultivo de caballitos de mar a partir de la clonación y la secuenciación de los genes 16S rRNA. Esta información permitirá obtener conocimiento que sirva de referencia para tomar acciones en posibles brotes infecciosos, y se espera que tendrá repercusiones positivas en las acciones de conservación, desarrollo de programas de reproducción y recuperación de poblaciones silvestres.

Participantes:
  • Dr. Renato Peña Martínez
  • Dr. Cesar Salvador Cardona Felix
  • M.C. Mauricio Contreras Olguín
  • Lic. Laura Guadalupe Flores Montijo