Resumen:
El phylum Actinobacteria está conformado por bacterias Gram positivas y se considera el responsable de la producción de casi el 90% de los antibióticos actualmente utilizados en la industria farmacéutica. El sedimento marino es un reservorio importante de actinobacterias marinas, lo que se traduce en un excelente ambiente para iniciar la búsqueda de cepas productoras de compuestos antimicrobianos novedosos. La naturaleza química de los compuestos con actividad antimicrobiana producidos por las actinobacterias es diversa y dentro de estos se encuentra un grupo de agentes terapeúticos conocidos como péptidos antimocrobianos (PAM). Estudios previos han propuesto que los sedimentos del Golfo de California pueden albergar distintos taxa de actinobacterias con un gran potencial farmacológico, por lo que el presente estudio pretende evaluar el potencial biosintéticos de péptido sintetasas no ribosomales (NRPS) en 30 cepas de Streptomyces aisladas de sedimentos de la Bahía de La Paz, B.C.S. Para la detección de genes asociados con las NRPS, se realizará una PCR con oligonucleótidos específicos para los dominios de adenilación de éstas peptido sintetasas. Las cepas seleccionadas se cultivarán en medio líquido y con los sobrenadantes se harán ensayos de actividad antimicrobiana frente a cepas patógenas de interés clínico. Por otro lado, se evaluarán a través de cromatografía en capa fina (TLC), para establecer si la actividad es debida a un compuesto de naturaleza peptídica producido por las cepas. Se realizarán electroforesis en geles de poliacrilamida (SDS-PAGE) para conocer el perfil de proteínas. Finalmente mediante análisis de cromatografía líquida de alta presión (HPLC) en combinación con espectrofotometría de masas y espectrometría UV-VIS, se espera obtener un perfil de la diversidad metabólica de las cepas seleccionadas.