Resumen:
El género Bacillus consta de más de 222 especies reconocidas, distribuidas ampliamente en muchos hábitats tanto terrestres como acuáticos, incluyendo sedimentos y como simbiontes de organismos marinos. Convencionalmente, los Bacilos han sido identificados en el laboratorio a través de técnicas bioquímicas y perfiles de ácidos grasos. Estos procedimientos son técnicamente complejos y la escasez de características fenotípicas reproducibles y distinguibles por varias especies bacterianas, a menudo hace que la identificación se dificulte. Hasta la fecha, el desarrollo de técnicas de amplificación de genes y secuenciación, especialmente la del gen 16S ARNr, ha simplificado la identificación y la detección de bacterias específicas, especialmente aquellas que carecen de características fenotípicas distinguibles. En un trabajo previo realizado por nuestro grupo de trabajo, se aislaron de la esponja Aplysina gerardogreeni del Golfo de California 35 especies pertenecientes al género Bacillus, las cuales mostraron actividad biológica en los ensayos realizados. Los resultados del análisis filogenético y de similitud reflejaron un nivel relativamente alto de diversidad de secuencias del género Bacillus, sin embargo, estas a veces muestran variación limitada para los miembros de taxones estrechamente relacionados, debido a la naturaleza conservada del gen 16S, lo cual no permitió discernir entre las especies de este género. Como una alternativa para complementar estos análisis, en este proyecto se pretende emplear genes codificantes de proteína como el rpoB, el cual se ha propuesto como un marcador potencial para resolver los problemas de identificación que permitan la asignación a nivel de especie del género Bacillus.