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Resumen del producto

Luna Sánchez, J.A., F.J., García Rodríguez, A., Munguía Vega & C., Quiñonez Velázquez (2023). Diversidad y diferenciación genómica poblacional de Opisthonema libertate en el noroeste de México. XXXI Taller del Comité Técnico para el Estudio de los Pelágicos Menores. México, 13 de junio, 2023, 1.

Diversidad y diferenciación genómica poblacional de Opisthonema libertate en el noroeste de México

Javier Alejandro Luna Sánchez 1, Francisco Javier García Rodríguez 1, Adrián Munguía Vega 2 y Casimiro Quiñonez Velázquez 1

1 Instituto Politécnico Nacional, Centro Interdisciplinario de Ciencias Marinas, Departamento de Pesquerías y Biología Marina
2 The University of Arizona
El complejo sardina crinuda se conforma de tres especies del género Opisthonema (O. libertate, O. bulleri y O. medirastre), las cuales son capturadas por la pesca comercial en el Pacífico mexicano. Hay relativamente poca información sobre la diversidad y la estructura poblacional a nivel genético a pesar de la importancia pesquera de este grupo y de la relevancia de entender los procesos de divergencia a nivel microevolutivo. Los análisis morfométricos y biológicos enfocados en la detección de grupos fenotípicos basados en O. libertate han sugerido la presencia de distintos morfotipos y stocks pesqueros. Sin embargo, los análisis genéticos (basados en secuencias de ADNmt) han sugerido la presencia de una población panmíctica, caracterizada por la ausencia de diferencias genéticas entre localidades. El presente estudio, profundiza el análisis de la estructura poblacional de la sardina crinuda O. libertate a partir de información genómica basados en SNPs, obtenidos mediante el protocolo ddRAD-seq. La identificación taxonómica fue soportada con caracteres merísticos y con secuencias genéticas (COI). A partir de individuos obtenidos de la costa occidental de la península de Baja California (n=?) y del golfo de California (n=) se obtuvieron 4,141 sitios variantes (SNPs) con una cobertura media de 68.8x. Sin embargo, después de remover individuos y sitios con más del 10% de datos faltantes, se redujo el número de sitios variantes a un total de 2,255, los cuales fueron empleados para los análisis posteriores. Los resultados sugieren que, a nivel genómico, O. libertate tiene una elevada diversidad y, con base en el AMOVA, poca diferenciación entre los sitios de colecta, tal como había sido reportado a partir de información del ADN mitocondrial. La ausencia de una clara estructura genómica poblacional fue también observada en el espacio multivariado (PCA y DAPC) y a partir de la asignación bayesiana. Los resultados de este estudio aportan información relevante relacionado con la elevada conectividad genética, la cual indica la necesidad de implementar estrategias coordinadas en el área de pesca.

Palabras clave: Estructura genómica; sardina crinuda; ddRAD-seq

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