Resumen del producto

¹ Instituto Politécnico Nacional, Centro Interdisciplinario de Ciencias Marinas

El complejo sardina crinuda se conforma de tres especies del género Opisthonema (O. libertate, O. bulleri y O.medirastre), las cuales son capturadas por la pesca comercial en el Pacífico mexicano. Hay relativamente poca información que explora la diversidad y la estructura poblacional a nivel genético, a pesar de la importancia pesquera de este grupo y de la relevancia de tener una mejor caracterización a nivel poblacional. Los análisis morfométricos enfocados en la detección de grupos fenotípicos se han realizado únicamente en O. libertate y han sugerido la presencia de distintos morfotipos. Sin embargo, los análisis genéticos (basados en secuencias de ADNmt) en la misma especie ha soportaron la presencia de una población panmíctica, caracterizada por la ausencia de diferencias genéticas entre localidades. El presente estudio, pretende profundizar en el análisis de la estructura poblacional de la sardina crinuda a partir de datos genómicos, particularmente de SNPs, obtenidos mediante el protocolo ddRAD-seq. Las muestras se obtuvieron de los sitios de desembarque de Mazatlán (n=42) y Bahía Magdalena (n=58) de enero de 2019. Mediante el programa Stacks ejecutado en la plataforma Linux, las lecturas crudas fueron demultiplexadas, con la finalidad de construir loci de novo y posteriormente detectar loci neutrales y adaptativos. Para cada conjunto de datos se estimó la diversidad genómica (He y Ho) y se obtuvo el valor de FST para cuantificar la diferenciación genómica.

Palabras clave: Estructura genética; sardina crinuda; ddRAD-seq

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